کتابخانه مرکزی دانشگاه مذاهب اسلامی همانند دیگر کتابخانه های دانشگاهی جوابگوی نیاز های اطلاعاتی اساتید و دانشجویان در حوزه ها و رشته های تخصصی این دانشگاه است. این کتابخانه در سال ۱۳۷۳با تعداد محدودی کتاب خریداری شده از نمایشگاه بین المللی کتاب تأسیس گردید. ابتدا کتابها در چند قفسه تقریبا بدون نظم موضوعی چیده شده بود. با توجه به افزایش کتب خریداری شده از سال ۱۳۷۷ به منظور ارتقای سطح کمی و کیفی فعّالیّتها ، طرح تهیّه سیستمهای رایانهای در دستور کار فعّالیّتهای اجرایی قرار گرفت . تهیّه نرم افزار تحت DOS پارس آذرخش، گام مهمی به سوی مکانیزه کردن خدمات کتابخانه بود. در سال ۱۳۷۸ این نرم افزار به صورت شبکه ناوول درآمد و امانت کتاب به صورت خودکارانجام پذیرفت و از این سال با اداره کتابخانه توسط یک متخصص کتابداری، و به منظور استانداردسازی منابع، استفاده از طرح رده بندی کنگره(LC) در دستور کار قرار گرفت
کتابخانه مرکزی هم اینک طرح راه اندازی کتابخانه دیجیتالی و فعّالیّت در محیط اینترنت را در دست بررسی دارد . در حال حاضر این کتابخانه با بیش از ۲۶۲۵۴ نسخه کتاب فارسی و عربی و تعداد ۱۰۰۸ عنوان کتاب لاتین ؛ و ۱۶۰عنوان نشریه و ورود اطلاعات کتابشناختی ۱۰۲۵۲عنوان مقاله در نرم افزار کتابخانه آذرسا ، در امر پاسخگویی به نیاز های اطلاعاتی مراجعان بسیار فعالیت می کند .