تشکیل کتابخانه مرکزی دانشگاه علوم پزشکی تبریز در سال ۱۳۶۶ همزمان با جدا شدن وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی از وزارت فرهنگ و آموزش عالی، و تفکیک دانشگاههای علوم پزشکی ، بطور موقت در کتابخانه دانشکده پزشکی شروع به فعالیت کرد . در ۱۳۸۰ همزمان با انتقال دانشکده پزشکی به ساختمان جدید، از کتابخانه دانشکده پزشکی تفکیک و به محل مرکز توسعه مطالعات پزشکی ( پشمینه سابق ) منتقل گردید.
محل ساختمان اصلی کتابخانه مرکزی ، زمانیکه در دانشگاه تفکیک مطالعات منطقه ای توسط مشاورین ایران اک انجام گرفت ، محل فعلی به عنوان کتابخانه مرکزی علوم پزشکی اختصاص یافت و قرارداد آن در سال ۱۳۷۵ طبق موافقتنامه ای بسته شد ولی عملیات اجرائی از سال ۱۳۸۰ شروع و در سال ۱۳۸۶ خاتمه یافت .
در حال حاضر کتابخانه مرکزی در بنایی به مساحت ۵۷۰۰ متر مربع در پنج طبقه فعالیت خود را شروع کرده است.
کتابخانه مرکزی به عنوان قلب کتابخانه های دانشگاه علوم پزشکی وظیفه هماهنگی و رسیدگی به کلیه امور کتابخانه های زیر مجموعه خود را به عهده دارد.
دانشکده مدیریت و اطلاع رسانی پزشکی این دانشگاه مجهز به سیستم RFID می باشد.
