دانشکده علوم پزشکی زاهدان در محل مجتمع آموزشی حضرت فاطمه زهرا (س) واقع در میدان مشاهیر زاهدان از مهرماه ۱۳۶۵ با تعداد ۵۰ دانشجو در رشته پزشکی و چند رشته کاردانی آغاز به فعالیت نمود.
وجود یک بیمارستان تیپ یک عالی، ۷ بیمارستان تیپ یک و ۳ بیمارستان تیپ دو در استان ، ساخت مراکز بهداشتی درمانی و خانه های بهداشت حتی در دور افتاده ترین نقاط استان شامل ۶۴ مرکز بهداشتی درمانی شهری ، ۹۵ مرکز روستائی ، ۷۳۵ خانه بهداشت و ۲۶ پایگاه بهداشتی در استان ، همه و همه نشان از توجه ویژه نظام به استان کمتر توسعه یافته سیستان و بلوچستان و تلاش های شبانه روزی سامانه بهداشت و درمان با همکاری دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی استان می باشد.